1961
12.15
由兩位聖母醫療傳教會愛爾蘭修女柯淑賢及蘇蘊芳創立,以產科醫療開始。
1963
醫師裴惠蘭修女亦加入聖母產院(聖母醫院的前身)的行列。
1967
30張病床設置完成。
1975
仁愛修女會開始接辦醫院,AGNES MCPHEE修女接任第二任院長並增設外科及小兒科。
1978
開刀房開始 X光室及物理治療室陸續開始啟用。
1981
開始社區醫療及居家護理服務,採取擴大山地鄉社區醫療保健服務。
1983
藉由白冷會幫助,醫院擴編X光室 、檢驗室及門診,並擴編為70床住院病床,開始強調婦幼健康照護。
1986
居家照護部門成立,更專業化地服務偏遠地區居民,包括山地鄉及離島地區。
1990
何谷婷修女接任本院第三任院長,開始第二次建築擴建及內部整修。
1991
政府補助本院物理治療。
1992
受榮總委託做台東地區AIDS及肝功能檢驗。
1994
整修醫院前廳、聖堂、開始擴建。
1995
擴大婦產科、小兒科服務、一般勞工體檢、汽機車駕駛人體檢成為全民健保特約醫院。
1996
擴建完成登記100張病床。
1997
三樓大禮堂完成。
1999
本國籍鄭雲修女接任本院第四任院長本院服務項目、已包括婦產科、內科、外科、小兒科、家醫科、物理治療、社區居家照護等。
2004
04.11
本院安寧病房開幕,名為「恩典家園」。
2007
05.26
本院心靈療癒花園開幕。
2008
05
5月 聖母健康會館(花蓮教區委託經營)開幕,供應民眾無毒、安全的全蔬食飲食,發展全方位健康促進。
06
榮獲第18屆團體醫療奉獻獎。
2009
03月
糖尿病治療權威林瑞祥教授到本院服務,成立糖尿病中心。
04月
喻永生醫師接任第五任院長。
2010
01月
聖母健康農莊(花蓮教區委託經營)開幕,種植無毒健康蔬果、推廣有機農業,營造優美園藝景觀。
03月
聖母老人日間照顧中心開幕,提供全人照顧,樂活晚年。
06月
林瑞祥教授接任第六任院長。
12月
12月 衛生署許可設立醫療財團法人、設立糖尿病中心。
2011
4月
臺東地方法院核准登記為醫療財團法人。
2012
設立芳香照護推廣中心。
2013
設立乳腺健康中心。
2014
設立長期照護輔具中心。
設立聖母樂齡健康活力中心。
12月16日
陳良娟接任第七任院長。
2016
12月25日
部落小家屋祝聖。
2017
4月28日
泰源保健室祝聖。
2018
4月4日
新增中醫科門診。
4月28日
聖母健康農莊新園開幕暨高齡服務中心啟用。
2022
12月16日
樂智幸福家-小規模多機能服務中心啟用。
2024
12月20日
陳良娟卸任院長轉任天主教花蓮教區醫療財團法人執行長。
12月21日
羅彥宇醫師接任第八任院長。